ポケモンマスターとはいろいろな解釈がありますが

あらゆるポケモンを使いこなす最強のポケモントレーナー
あらゆるポケモンと心を通わすトレーナー

ポケモンGOでは
最強のポケモントレーナー(ジムリーダー)
心を通わすトレーナー(ポケモンずかんを完成させる)等楽しみ方は色々です。
ポケモンずかんはアップデート等で増えていくのではないかと言われています。

ジムリーダーになる方法
ジムはポケストップに様にいたるところにあります。
赤色・青色・黄色と3つの種類があります

赤色 チーム ヴァーラー(ファイヤー)
青色 チーム ミスティック(フリーザー)
黄色 チーム インスティンクト(サンダー)

どのチームに入ったらゲームに有利!等の情報は今のところないので
好きな色や好きなポケモン等で選んで大丈夫です。
私は、赤色のチーム ヴァーラーです

ジムリーダーになるには相手チームのジムリーダーに勝ち
陣地を取らなくてはいけません。

ポケモンGOがリリースされてすぐは
CPの弱いポケモンでもジムリーダーになれていましたが
数日でCP1000以上のポケモンがジムにいる様になりました。
ジムリーダーになりたい人は、まずたくさんポケモンをゲットしトレーナーレベルをあげる事をおすすめします。
トレーナーレベルが上がると出てくるポケモンのCPも上がっていきます。
最初に出てくるポケモンはほとんどがCP二ケタですが、トレーナーレベルがあがると
CP三桁が増えていきます。

少し話がそれてしまいましたが…
人が少ない場所などはジムポケモンのCPも低かったりするので穴場です。
逆に街中は強いジムが多くなかなかジムリーダーになるのは難しかったりします。
ジムにもレベルがあり、レベル1はポケモン1匹(ジムリーダー1人)ですが
ジムのレベルがあがると、ポケモン・ジムリーダーの数も増えていきます。

相手ジムのポケモンに勝った場合、好きなポケモンを置いていけます。
選ぶポケモンは自由です。
その後、そのポケモンが誰かに負けた場合、自分のところへ戻ってくるので
ポケモンが減る心配はありません。
なので、強いお気に入りポケモンを置いていっても大丈夫です。

最強のポケモンマスター(ジムリーダー)になる為には
トレーナーレベルを上げましょう。